داستان در هینوموتو، ادو و در دوره‌ای طوفانی می‌گذره که بعدها به نام باکوماتسو شناخته شد؛ دورانی که کشور در آستانهٔ تغییرات بزرگی قرار داره.در این دنیا، Battle Spirits از قدیم فقط به سامورایی‌ها و جنگجویان اجازه می‌داد وارد میدان مقدس نبرد شوند. در نبردی به نام «Eternal»، باختن فقط به معنی شکست نبود؛ بازنده باید جانش را نیز فدا می‌کرد. اما با ظهور کارت‌های جدید و سبک مبارزهٔ تازه‌ای به نام «Standard»، بتل اسپیریتس میان مردم عادی هم در حال گسترش است.
